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BLAST中blastx和tblastn的區別有哪些

小億
764
2023-08-03 15:44:34
欄目: 編程語言

BLAST是一種常用的序列比對工具,用于比對蛋白質和核酸序列。BLASTx和tBLASTn是BLAST工具中的兩種不同的搜索算法。

  1. BLASTx:BLASTx是將一個蛋白質序列與一個核酸數據庫進行比對。它將蛋白質序列翻譯成所有可能的核酸序列(六種閱讀框),然后將這些序列與目標核酸序列進行比對。BLASTx常用于通過蛋白質序列找到與其相似的核酸序列。

  2. tBLASTn:tBLASTn是將一個核酸序列與一個蛋白質數據庫進行比對。它將目標核酸序列進行翻譯,得到所有可能的蛋白質序列,然后將這些序列與蛋白質數據庫進行比對。tBLASTn常用于通過核酸序列找到與其相似的蛋白質序列。

因此,BLASTx和tBLASTn的區別在于搜索的對象不同,BLASTx搜索蛋白質序列與核酸數據庫的比對,而tBLASTn搜索核酸序列與蛋白質數據庫的比對。

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