miRNA數據庫是專門用于存儲和管理微小RNA（miRNA）相關信息的數據庫，它們包含了從基礎的序列信息到復雜的生物學功能注釋等多方面的數據。以下是一些關于miRNA數據庫的詳細信息：
主要內容
- miRNA序列信息：包括已知的miRNA序列、前體、成熟體等。
- 靶基因預測：通過分析miRNA與靶基因的互作關系，提供靶基因的預測結果。
- 表達譜和調控網絡：包含miRNA在不同組織或生物過程中的表達模式，以及參與的調控網絡。
- 功能注釋：提供miRNA調控的信號通路、與疾病的關聯等信息。
- 疾病關聯數據：收集實驗支持的miRNA與疾病相關數據，幫助研究人員快速查找與特定miRNA相關的疾病信息。
常見的miRNA數據庫及其特點
- miRBase：提供全球最全面的miRNA序列信息，包括已知的miRNA序列和注釋信息，是存儲miRNA信息最主要的公共數據庫之一。
- miRTarBase：收集和整合已驗證的miRNA靶向關系的數據庫，提供大量實驗驗證的miRNA-mRNA相互作用數據。
- TargetScan：用于預測miRNA靶向基因的數據庫，基于miRNA與mRNA的互補匹配原則，通過分析mRNA的3’UTR序列來預測潛在的miRNA靶向位點。
- miRWalk：一個綜合性的miRNA靶基因預測數據庫，整合了多種預測算法的結果，提供多種miRNA預測工具的比較和綜合分析。
- HMDD 4.0：人類microRNA疾病數據庫，匯集了實驗支持的miRNA與疾病相關數據，提供了超過5000個miRNA和疾病之間的關聯信息。
數據庫的選擇
選擇合適的miRNA數據庫取決于研究的需求。例如，如果需要查詢miRNA基本信息和注釋，miRBase可能是一個好的選擇。如果希望預測miRNA的靶向基因或分析miRNA靶向關系的可靠性和功能，可以使用TargetScan或miRTarBase。
通過上述數據庫，研究人員可以更全面地了解miRNA的功能和調控機制，從而推動miRNA研究的不斷深入。
