mirna數據庫如何查詢數據

查詢miRNA數據主要可以通過以下幾個常用的數據庫進行：

1. miRBase

   • 簡介：miRBase是當前收錄miRNA信息最全面的綜合型公共數據庫之一，由曼徹斯特大學研究人員開發。它提供了搜索已發表miRNA序列和注釋信息，預測基因靶標等功能。
   • 查詢方法：訪問miRBase官網（http://www.mirbase.org/），在Search頁面可通過輸入miRNA的ID、關鍵詞、染色體位置等查詢已知的miRNA的信息。也可以提交miRNA序列，以序列比對的方式查找序列相似的已知miRNA。

2. LncBase v3.0

   • 簡介：LncBase v3.0是一個用于研究長鏈非編碼RNA（lncRNA）與miRNA（microRNA）相互作用的數據庫。它匯總了大量來自文獻和公共數據集的信息，包括已知的lncRNA-miRNA相互作用關系。
   • 查詢方法：在LncBase v3.0中，只需將目標的lncRNA或miRNA輸入到搜索框中，就可以直接進行查詢，輸出結果會列出具體的詳細信息，包括組織類型、參考文獻以及可信度等。

3. starbase

   • 簡介：starbase數據庫通過整合高通量的CLIP-Seq實驗數據（CLIP-Seq和HITS-CLIP）和降解組實驗數據（degradome sequencing）搜尋microRNA的靶標。提供了各式各樣的可視化界面去探討microRNA的靶標。
   • 查詢方法：在starbase數據庫中，可以通過輸入miRNA名稱進行搜索，查找與特定miRNA相互作用的靶基因。

4. miRTarBase

   • 簡介：miRTarBase是一個手工收集的，經過實驗驗證過的miRNA靶基因數據庫。它提供了miRNA靶基因的實驗驗證結果，可以幫助研究者更準確地了解miRNA的功能。
   • 查詢方法：訪問miRTarBase官網（http://mirtarbase.mbc.nctu.edu.tw/php/index.php），在搜索欄中輸入miRNA名稱進行查詢，可以找到與該miRNA相互作用的靶基因信息。

通過上述數據庫，您可以查詢到關于miRNA的詳細信息，包括它們的序列、靶基因、表達模式以及與其他分子的相互作用等。