這篇文章給大家分享的是有關linux中fastq文件如何查看指定序列的內容。小編覺得挺實用的，因此分享給大家做個參考，一起跟隨小編過來看看吧。
在處理fastq文件時，可能會遇到序列與質量值長度不一致或格式不正確等問題，這時候軟件會報告哪條序列有問題，并給出序列ID，然后我們就要去查看這條序列是什么問題。但是，fastq文件通常是很大的，使用less命令可能很難搜索到，這時候我們可以用到下面的命令來查看。
zcat /share/nas1/DATA/zx-20180122-15/XM8_H33TNDMXX_L1_2.clean.fq.gz |grep -E "A00164:71:H33TNDMXX:2:2438:30400:20353" -C 4 >xm8-2.txt &
其中zcat可以查看fastq壓縮文件，grep 匹配序列ID，參數 -C 4 可以輸出匹配行的前后四行。
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