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AMMI模型該怎么理解

發布時間:2021-12-10 11:07:39 來源:億速云 閱讀:319 作者:柒染 欄目:大數據

這篇文章將為大家詳細講解有關AMMI模型該怎么理解,文章內容質量較高,因此小編分享給大家做個參考,希望大家閱讀完這篇文章后對相關知識有一定的了解。

1. AMMI模型定義

AMMI的全稱:效可加互作可乘(Additive main multiplicative interaction, AMMI)。

AMMI通過從加性模型的殘差中分離模型誤差和干擾,提高估計的準確度。并且借助于雙標圖可以更直觀的描述和分析基因型與環境互作模式。

公式:

AMMI模型該怎么理解

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2. 主成分意義

參考:
https://www.slideshare.net/BalajiThorat/ammi-model-for-stability-analysis

AMMI分析中,將GbyE分為很多主成分,一般分析時使用PC1和PC2。

注意, 只有AMMI模型中PC1和PC2達到顯著,AMMI模型分析才有意義。
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2.1 PC1

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一般來說,PC1是品種與環境互作中,品種對環境的響應比例,可以理解為互作中環境的影響。

2.2 PC2

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PC2代表品種與環境互作中,可以理解為互作中不屬于環境影響的那一部分。

3. AMMI模型的兩個圖

AMMI模型分析中,一般做兩個圖:PC1 VS Means 和PC1 VS PC2。

3.1 PC1 VS Means

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這里X坐標為品種的觀測值(產量),Y坐標為
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  • 品種越靠右,說明品種產量越高

  • 地點越靠右,說明地點平均產量越高

  • 品種的y值越高或越低,說明互作效應越強

  • 品種或地點的PC1分數越接近于0,說明互作效應越小

  • 品種與地點越接近,說明品種在該地點適應性較好

3.2 PC1 VS PC2

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這里X坐標為PC1,Y坐標為PC2,通過這個圖,綜合考察基因與環境互作。

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這個圖,描述的是基因與環境互作,但是沒有考慮到G,只是顯示的GbyE,GGE雙標圖的出現,考察基因與環境互作,GGE更好。

關于AMMI模型該怎么理解就分享到這里了,希望以上內容可以對大家有一定的幫助,可以學到更多知識。如果覺得文章不錯,可以把它分享出去讓更多的人看到。

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