python加載dicom圖片怎么實現

這篇文章運用簡單易懂的例子給大家介紹python加載dicom圖片怎么實現，代碼非常詳細，感興趣的小伙伴們可以參考借鑒，希望對大家能有所幫助。

用python加載dicom圖片的方法：使用pydicom、CV2、numpy、matplotlib等庫即可。pydicom庫是專門用來處理dicom圖像的python專用庫。

python讀取DICOM圖像，需要以下幾個庫：pydicom、CV2、numpy、matplotlib。pydicom是專門處理dicom圖像的python專用包，numpy高效處理科學計算的包，依據數據繪圖的庫。

安裝需要的庫

pip install matplotlib

pip install opencv-python

pip install pydicom    
pip install numpy

安裝好這些庫后就可以對dicom文件操作了。

具體代碼如下：

#-*-coding:utf-8-*-
import cv2
import numpy
import dicom
from matplotlib import pyplot as plt

dcm = dicom.read_file("AT0001_100225002.DCM")
dcm.image = dcm.pixel_array * dcm.RescaleSlope + dcm.RescaleIntercept

slices = []
slices.append(dcm)
img = slices[ int(len(slices)/2) ].image.copy()
ret,img = cv2.threshold(img, 90,3071, cv2.THRESH_BINARY)
img = numpy.uint8(img)

im2, contours, _ = cv2.findContours(img,cv2.RETR_LIST,cv2.CHAIN_APPROX_SIMPLE)
mask = numpy.zeros(img.shape, numpy.uint8)
for contour in contours:
 cv2.fillPoly(mask, [contour], 255)
img[(mask > 0)] = 255


kernel = cv2.getStructuringElement(cv2.MORPH_ELLIPSE,(2,2))
img = cv2.morphologyEx(img, cv2.MORPH_OPEN, kernel)


img2 = slices[ int(len(slices)/2) ].image.copy()
img2[(img == 0)] = -2000


plt.figure(figsize=(12, 12))
plt.subplot(131)
plt.imshow(slices[int(len(slices) / 2)].image, 'gray')
plt.title('Original')
plt.subplot(132)
plt.imshow(img, 'gray')
plt.title('Mask')
plt.subplot(133)
plt.imshow(img2, 'gray')
plt.title('Result')
plt.show()

在DICOM圖像里，包含了患者的相關信息的字典，我們可以通過dir查看DICOM文件有什么信息，可以通過字典返回相關的值。

import dicom
import json
def loadFileInformation(filename):
 information = {}
 ds = dicom.read_file(filename)
 information['PatientID'] = ds.PatientID
 information['PatientName'] = ds.PatientName
 information['PatientBirthDate'] = ds.PatientBirthDate
 information['PatientSex'] = ds.PatientSex
 information['StudyID'] = ds.StudyID
 information['StudyDate'] = ds.StudyDate
 information['StudyTime'] = ds.StudyTime
 information['InstitutionName'] = ds.InstitutionName
 information['Manufacturer'] = ds.Manufacturer
 print dir(ds)
 print type(information)
 return information

a=loadFileInformation('AT0001_100225002.DCM')
print a

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