在CentOS系統上集成Fortran與MPI(Message Passing Interface)可以用于高性能計算。以下是詳細的步驟和方法:
首先,你需要在CentOS系統上安裝MPI庫。常見的MPI實現包括MPICH和OpenMPI。以下是使用MPICH的步驟:
下載并解壓MPICH:
wget http://www.mpich.org/static/downloads/3.2/mpich-3.2.1.tar.gz
tar -xzvf mpich-3.2.1.tar.gz -C /home/mpiuser/mpich/
cd /home/mpiuser/mpich/mpich-3.2.1/
配置和安裝:
./configure --prefix=/home/mpiuser/mpich
make && make install
設置環境變量:
編輯~/.bashrc
文件,添加以下內容:
export PATH=/home/mpiuser/mpich/bin:$PATH
export LD_LIBRARY_PATH=/home/mpiuser/mpich/lib:$LD_LIBRARY_PATH
執行以下命令使配置生效:
source ~/.bashrc
使用Fortran編譯器(如gfortran或ifort)編譯MPI程序。以下是一個簡單的示例程序:
program hello_world_mpi
use mpi
implicit none
integer :: process_rank, size_of_cluster, ierror
call mpi_init(ierror)
call mpi_comm_size(mpi_comm_world, size_of_cluster, ierror)
call mpi_comm_rank(mpi_comm_world, process_rank, ierror)
print *, 'Hello world from process:', process_rank
call mpi_finalize(ierror)
end program hello_world_mpi
使用mpirun
或mpiexec
命令運行編譯后的程序。例如:
mpirun -np <core-count> ./hello_world_mpi
或者使用mpiexec
:
mpiexec -np <core-count> ./hello_world_mpi
對于多節點環境,需要進行以下配置:
配置主機文件:
編輯/etc/hosts
文件,確保所有節點可以互相ping通。
設置SSH無密碼登錄: 在每個節點上生成SSH密鑰,并將公鑰發送給其他節點。
ssh-keygen -t rsa
ssh-copy-id mpiuser@other_node
在主節點上運行mpirun
或mpiexec
命令,指定所有節點:
mpirun -np <total_core_count> -host node1,node2,node3 ./hello_world_mpi
通過以上步驟,你可以在CentOS系統上成功集成Fortran與MPI,進行高性能并行計算。