lncRNA(長非編碼RNA)數據庫的數據來源主要包括以下幾種:
- RNA Central:整合了NCBI GenBank、European Nucleotide Archive (ENA)、DNA Data Bank of Japan (DDBJ)、RefSeq、Rfam、miRBase等多個公共數據庫中的RNA序列和注釋信息。此外,還包括文獻報道中的RNA序列和相關信息,以及來自其他數據庫的RNA序列和結構數據。
- RiceLncPedia:專門收集整理水稻(Oryza sativa)長鏈非編碼RNA(lncRNA)的數據庫,數據來源于NCBI GenBank、RAP-DB、TIGR Rice Genome Annotation Project、MSU Rice Genome Annotation Project Database、Rice Genome Resource Center等。
- LncRNADisease:可以查看lncRNA與疾病關系的數據庫,數據來源包括文獻報道和其他公共數據庫。
- NONCODE:收集和整合了全球范圍內的非編碼RNA序列和注釋信息,數據來源包括GENCODE、RefSeq、Ensembl和其他公共數據庫。
- LNCipedia:廣泛收集、注釋和分類lncRNA的數據庫,數據來源于公開可獲得的文獻和其他公共數據庫,如GENCODE和Ensembl。
- LncBook:整合了GENCODE、NONCODE、CHESS、LNCipedia、FANTOM-CAT、BIGTranscriptome等10余個數據庫的lncRNA數據,提供全面高質量的人類lncRNA集合和參考文件。
這些數據庫通過整合不同來源的RNA序列和注釋信息,為RNA生物學研究提供了一個全面而準確的資源,促進了RNA研究的發展。