這篇文章給大家分享的是有關BLAST+怎么用的內容。小編覺得挺實用的，因此分享給大家做個參考，一起跟隨小編過來看看吧。
BLAST+是使用非常廣泛的序列比對軟件，有NCBI提供
BLAST+是使用非常廣泛的序列比對軟件，有NCBI提供，下載地址為：
ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/
使用方法如下：
格式化數據庫
makeblastdb -in db.fasta -dbtype prot -parse_seqids -out dbname
參數說明:
-in：待格式化的序列文件
-dbtype：數據庫類型，prot或nucl
-out：數據庫名
蛋白序列比對蛋白數據庫（blastp）
blastp -query seq.fasta -out seq.blast -db dbname -outfmt 6 -evalue 1e-5 -num_descriptions 10 -num_threads 8
參數說明:
-query： 輸入文件路徑及文件名
-out：輸出文件路徑及文件名
-db：格式化了的數據庫路徑及數據庫名
-outfmt：輸出文件格式，總共有12種格式，6是tabular格式對應BLAST的m8格式
-evalue：設置輸出結果的e-value值
-num_descriptions：tabular格式輸出結果的條數
-num_threads：線程數
核酸序列比對核酸數據庫（blastn）以及核酸序列比對蛋白數據庫（blastx）
與上面的blastp用法類似：
blastn -query seq.fasta -out seq.blast -db dbname -outfmt 6 -evalue 1e-5 -num_descriptions 10 -num_threads 8
blastx -query seq.fasta -out seq.blast -db dbname -outfmt 6 -evalue 1e-5 -num_descriptions 10 -num_threads 8
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