小編給大家分享一下如何使用R語言繪制箱線圖，相信大部分人都還不怎么了解，因此分享這篇文章給大家參考一下，希望大家閱讀完這篇文章后大有收獲，下面讓我們一起去了解一下吧！
箱線圖，又稱盒形圖，常用來展示數據的整體分布情況，也是目前科研論文中經常出現的一類圖形。標準的箱線圖包含幾個重要的元素，如下圖所示，包括下四分位數（第25%數據的大?。?、上四分位數（75%數據的大?。?、中位數等（中位數大?。┑鹊?。這種箱線圖怎么畫？這里教你用最簡單的R代碼畫出基礎的箱線圖，兩行三行搞定箱線圖！
此處準備了24個樣本3000個基因的表達數據，由此進行畫圖。數據原始文件是tab分隔的文本文件，讀取數據保存到向量data中，矩陣的基本內容如下（顯示5行數據）：
> head(data,5) CK-WT-1 CK-WT-2 CK-WT-3 CK-tdr1-1 CK-tdr1-2 CK-tdr1-3 NaWT-1 NaWT-2 NaWT-3 Natdr1-1 AT1G01010 3.741490 7.361800 5.8173400 5.7113100 7.9705400 10.3762000 6.29949 5.550620 5.847790 15.588100 AT1G01030 5.235280 2.770700 2.6685900 3.2263200 1.3210500 1.9672600 2.40259 3.230770 4.803780 2.043010 AT1G01040 2.821317 1.563395 1.9316282 3.1948090 2.6008540 2.3012776 2.04436 2.104095 2.630611 2.289544 AT1G01050 118.660000 140.143000 123.3830000 97.2229000 95.2539000 91.8525000 121.80800 125.135000 106.507000 81.699700 AT1G01060 1.873769 16.909025 0.9559375 0.4774184 0.5273923 0.4333881 39.10658 36.530250 19.456131 13.222704 Natdr1-2 Natdr1-3 Na-WT-1 Na-WT-2 Na-WT-3 Na-tdr1-1 Na-tdr1-2 Na-tdr1-3 SWT-1 SWT-2 SWT-3 AT1G01010 14.763600 17.746700 9.849430 7.97949 6.841060 13.291200 25.370000 19.599400 4.966870 5.533490 3.188160 AT1G01030 2.295240 1.952860 1.833770 1.70757 0.809564 3.231720 1.804780 2.060440 8.492560 2.655640 2.255700 AT1G01040 2.801336 2.450605 3.419992 3.50951 2.388678 3.109170 3.559722 2.699009 3.533361 2.779014 1.973365 AT1G01050 84.849500 80.389500 95.484700 93.47060 78.313200 77.220800 93.267700 81.656100 204.019000 251.292000 257.625000 AT1G01060 10.889778 12.258010 74.498380 80.83165 22.768773 1.109817 2.482441 34.885769 209.860515 54.164781 11.474413 Stdr1-1 Stdr1-2 Stdr1-3 AT1G01010 6.936500 7.8840200 11.2504000 AT1G01030 4.352980 4.5214700 7.1135100 AT1G01040 5.528830 4.9230430 5.6020740 AT1G01050 85.227500 77.5347000 84.9365000 AT1G01060 3.502854 0.9064844 0.3295299
箱線圖比較適合對較大數據量進行圖片展示，所以實際的繪圖的數據可以是來源于不同研究、不同對象的多種統計數據，不拘于案例演示的基因表達數據。
利用boxplot基礎繪圖函數繪制箱線圖，除顏色和相關設置之外，只需這基礎的一步即可繪制出完整的圖片（如下）：
cols=rainbow(24) ###針對24個樣本，設置顏色，整體呈現彩虹色 par(cex=0.5) ###設置字體大小 boxplot(data,las=2,main="expression",outline = F,col = cols,notch = T) ###繪圖
這里用到的繪圖函數boxplot相應的參數解釋如下，如需要了解更多參數，對圖片進行美化，查詢繪圖函數即可。
#data 繪圖矩陣
#las 控制坐標軸標簽方向
#main 圖片title
#outline 是否顯示異常值
#col 圖片顏色
#notch 是否顯示楔形缺刻
以上是“如何使用R語言繪制箱線圖”這篇文章的所有內容，感謝各位的閱讀！相信大家都有了一定的了解，希望分享的內容對大家有所幫助，如果還想學習更多知識，歡迎關注億速云行業資訊頻道！
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