生產環境使用 pt-table-checksum 檢查MySQL數據一致性

公司數據中心從托管機房遷移到阿里云，需要對mysql遷移（Replication）后的數據一致性進行校驗，但又不能對生產環境使用造成影響，pt-table-checksum 成為了絕佳也是唯一的檢查工具。

pt-table-checksum 是 Percona-Toolkit 的組件之一，用于檢測MySQL主、從庫的數據是否一致。其原理是在主庫執行基于statement的sql語句來生成主庫數據塊的checksum，把相同的sql語句傳遞到從庫執行，并在從庫上計算相同數據塊的checksum，最后，比較主從庫上相同數據塊的checksum值，由此判斷主從數據是否一致。檢測過程根據唯一索引將表按row切分為塊（chunk），以為單位計算，可以避免鎖表。檢測時會自動判斷復制延遲、 master的負載， 超過閥值后會自動將檢測暫停，減小對線上服務的影響。

pt-table-checksum 默認情況下可以應對絕大部分場景，官方說，即使上千個庫、上萬億的行，它依然可以很好的工作，這源自于設計很簡單，一次檢查一個表，不需要太多的內存和多余的操作；必要時，pt-table-checksum 會根據服務器負載動態改變 chunk 大小，減少從庫的延遲。

為了減少對數據庫的干預，pt-table-checksum還會自動偵測并連接到從庫，當然如果失敗，可以指定--recursion-method選項來告訴從庫在哪里。它的易用性還體現在，復制若有延遲，在從庫 checksum 會暫停直到趕上主庫的計算時間點（也通過選項--設定一個可容忍的延遲最大值，超過這個值也認為不一致）。

為了保證主數據庫服務的安全，該工具實現了許多保護措施：

1. 自動設置 innodb_lock_wait_timeout 為1s，避免引起

2. 默認當數據庫有25個以上的并發查詢時，pt-table-checksum會暫停?？梢栽O置 --max-load 選項來設置這個閥值

3. 當用 Ctrl+C 停止任務后，工具會正常的完成當前 chunk 檢測，下次使用 --resume 選項啟動可以恢復繼續下一個 chunk

工作過程

直接看 nettedfish 的說明：

1\. 連接到主庫：pt工具連接到主庫，然后自動發現主庫的所有從庫。默認采用show full processlist來查找從庫，但是這只有在主從實例端口相同的情況下才有效。
3\. 查找主庫或者從庫是否有復制過濾規則：這是為了安全而默認檢查的選項。你可以關閉這個檢查，但是這可能導致checksum的sql語句要么不會同步到從庫，要么到了從庫發現從庫沒有要被checksum的表，這都會導致從庫同步卡庫。
5\. 開始獲取表，一個個的計算。
6\. 如果是表的第一個chunk，那么chunk-size一般為1000；如果不是表的第一個chunk，那么采用19步中分析出的結果。
7\. 檢查表結構，進行數據類型轉換等，生成checksum的sql語句。
8\. 根據表上的索引和數據的分布，選擇最合適的split表的方法。
9\. 開始checksum表。
10\. 默認在chunk一個表之前，先刪除上次這個表相關的計算結果。除非–resume。
14\. 根據explain的結果，判斷chunk的size是否超過了你定義的chunk-size的上限。如果超過了，為了不影響線上性能，這個chunk將被忽略。
15\. 把要checksum的行加上for update鎖，并計算。
17-18\. 把計算結果存儲到master_crc master_count列中。
19\. 調整下一個chunk的大小。
20\. 等待從庫追上主庫。如果沒有延遲備份的從庫在運行，最好檢查所有的從庫，如果發現延遲最大的從庫延遲超過max-lag秒，pt工具在這里將暫停。
21\. 如果發現主庫的max-load超過某個閾值，pt工具在這里將暫停。
22\. 繼續下一個chunk，直到這個table被chunk完畢。
23-24\. 等待從庫執行完checksum，便于生成匯總的統計結果。每個表匯總并統計一次。
25-26\. 循環每個表，直到結束。

校驗結束后，在每個從庫上，執行如下的sql語句即可看到是否有主從不一致發生：

select * from percona.checksums where master_cnt <> this_cnt OR master_crc <> this_crc OR ISNULL(master_crc) <> ISNULL(this_crc) \G 

你需要知道的選項

• --replicate-check：執行完 checksum 查詢在percona.checksums表中，不一定馬上查看結果呀 —— yes則馬上比較chunk的crc32值并輸出DIFFS列，否則不輸出。默認yes，如果指定為--noreplicate-check，一般后續使用下面的--replicate-check-only去輸出DIFF結果。

• --replicate-check-only：不在主從庫做 checksum 查詢，只在原有 percona.checksums 表中查詢結果，并輸出數據不一致的信息。周期性的檢測一致性時可能用到。

• --nocheck-binlog-format：不檢測日志格式。這個選項對于 ROW 模式的復制很重要，因為pt-table-checksum會在 Master和Slave 上設置binlog_format=STATEMENT（確保從庫也會執行 checksum SQL），MySQL限制從庫是無法設置的，所以假如行復制從庫，再作為主庫復制出新從庫時（A->B->C），B的checksums數據將無法傳輸。（沒驗證）

• --replicate= 指定 checksum 計算結果存到哪個庫表里，如果沒有指定，默認是 percona.checksums 。
  但是我們檢查使用的mysql用戶一般是沒有 create table 權限的，所以你可能需要先手動創建：

CREATE DATABASE IF NOT EXISTS percona; CREATE TABLE IF NOT EXISTS percona.checksums (
    db CHAR(64) NOT NULL,
    tbl CHAR(64) NOT NULL,
    chunk INT NOT NULL,
    chunk_time FLOAT NULL,
    chunk_index VARCHAR(200) NULL,
    lower_boundary TEXT NULL,
    upper_boundary TEXT NULL,
    this_crc CHAR(40) NOT NULL,
    this_cnt INT NOT NULL,
    master_crc CHAR(40) NULL,
    master_cnt INT NULL,
    ts TIMESTAMP NOT NULL DEFAULT CURRENT_TIMESTAMP ON UPDATE CURRENT_TIMESTAMP, PRIMARY KEY (db,tbl,chunk), INDEX ts_db_tbl(ts,db,tbl)
) ENGINE=InnoDB;

生產環境中數據庫用戶權限一般都是有嚴格管理的，假如連接用戶是repl_user（即直接用復制用戶來檢查），它應該額外賦予對其它庫的 SELECT ，LOCK TABLES 權限，如果后續要用 pt-table-sync 就就需要寫權限了。對percona庫有寫權限：

 GRANT ALL PRIVILEGEES on percona.* to repl_user@'%' IDENTIFIED BY 'repl_pass'; GRANT SELECT,LOCK TABLES,PROCESS,SUPER on *.* to repl_user@'%'; 

注：

1. 為了減少不必要的麻煩，確保你的 repl_user@'xxx' 用戶能同時登陸主庫和從庫

2. --create-replicate-table 選項會自動創建 percona.checksums 表，但也意味著賦予額外的 CREATE TABLE權限給 percona_tk@'xxx' 用戶。默認yes

3. PROCESS用于自動發現從庫信息，SUPER權限用于set binlog_format。

• --no-check-replication-filters 表示不需要檢查 Master 配置里是否指定了 Filter。 默認會檢查，如果配置了 Filter，如 replicate_do_db,replicate-wild-ignore-table,binlog_ignore_db 等，在從庫checksum就與遇到表不存在而報錯退出，所以官方默認是yes（--check-replication-filters）但我們實際在檢測中時指定--databases=，所以就不存在這個問題，干脆不檢測

• --empty-replicate-table：每個表checksum開始前，清空它之前的檢測數據（不影響其它表的checksum數據），默認yes。當然如果使用--resume啟動檢測數據不會清空。
  當啟用--noempty-replicate-table即不清空時，不計算計算chunk,只計算。

• --databases=，-d：要檢查的數據庫，逗號分隔。用腳趾頭想也知道 --databases-regex 正則匹配要檢測的數據庫，--ignore-databases[-regex]忽略檢查的庫。Filter選項。

• --tables=，-t：要檢查的表，逗號分隔。如果要檢查的表分布在不同的db中，可以用--tables=dbname1.table1,dbnamd2.table2的形式。同理有--tables-regex，--ignore-tables，--ignore-tables-regex。--replicate指定的checksum表始終會被過濾。

• --recursion-method：發現從庫的方式。pt-table-checksum 默認可以在主庫的 processlist 中找到從庫復制進程，從而識別出有哪些從庫，但如果使用是非標準3306端口，會導致找不到從庫信息。此時就會自動采用host方式，但需要提前在從庫 my.cnf 里面配置report_host、report_port信息，如：

   report_host = MASTER_HOST
      report_port = 13306 

最終極的辦法是dsn，dsn指定的是某個表（如 percona.dsns ），表行記錄是改主庫的（多個）從庫的連接信息。適用以下任一情形：

1. 主庫不能自動發現從庫

2. 不想在從庫添加額外配置（因為要重啟）

3. 主從檢測連接用戶信息不一樣

4. 多個從庫時只想驗證指定從庫的一致

我比較傾向使用DSN的方式。這個dsns表只需要在執行 pt-table-checksum 命令的服務器上能夠訪問到就行。這里糾正一個認識，網上很多人說 pt-table-checksum 要在主庫上執行，其實不是的，我的mysql實例比較多，只需在某一臺服務器上安裝percona-toolkit，這臺服務能夠同時訪問主庫和從庫就行了。具體用法見后面實例。

檢測實例

同網段間主從一致檢查

場景：

1. 標準端口3306，只檢查某一個庫的關鍵表

2. 一主一從，binlog不是ROW模式

3. 同網段復制，percona_tk@'192.168.5.%' 具備該有的權限：

    GRANT ALL PRIVILEGEES on repl_user.* to repl_user@'192.168.5.%' IDENTIFIED BY 'repl_pass'; GRANT SELECT,LOCK TABLES,PROCESS,SUPER on *.* to repl_user@'192.168.5.%'; 

這是最簡單的方式，把要連接和檢查的信息交代就行了：

# pt-table-checksum h=MASTER_HOST,u=repl_user,p='repl_pass',P=3306 \ --databases=d_ts_profile --tables=t_user,t_user_detail,t_user_group --nocheck-replication-filters

如果是首次運行，會在主庫自動創建 percona.checksums 表。

輸出結果：

Replica lag is 2307 seconds on mysql-5. Waiting. Checksumming d_ts_profile.t_user_account:   3% 54:48 remain TS ERRORS DIFFS ROWS CHUNKS SKIPPED TIME TABLE 12-18T16:07:48 0      0   313641       9       0 146.417 d_ts_profile.t_user 12-18T16:08:00 0      0   397734      12       0  11.747 d_ts_profile.t_user_detail 12-18T16:08:24 0      0  1668327      20       0  23.941 d_ts_profile.t_user_group

• TS ：完成檢查的時間戳。

• ERRORS ：檢查時候發生錯誤和警告的數量。

• DIFFS ：不一致的chunk數量。當指定 --no-replicate-check 即檢查完但不立即輸出結果時，會一直為0；當指定 --replicate-check-only 即不檢查只從checksums表中計算crc32，且只顯示不一致的信息（畢竟輸出的大部分應該是一致的，容易造成干擾）。

• ROWS ：比對的表行數。

• CHUNKS ：被劃分到表中的塊的數目。

• SKIPPED ：由于錯誤或警告或過大，則跳過塊的數目。

• TIME ：執行的時間。

• TABLE ：被檢查的表名

使用dsn跨數據中心檢測

場景：

1. 非標準端口13306，只檢查以 d_ts 開頭的所有庫

2. 一主二從，binlog是ROW模式，其中一從在阿里云ECS上，主庫是無法直接訪問該從庫的

3. 檢測用的賬號因為不是%，所以不一樣

4. 以下是我環境的情況
   MASTER_HOST:13306 主庫

REPLICA_HOST:3306 從庫
PTCHECK_HOST pt-table-checksum所在服務器
DSN_DBHOST，記錄從庫（連接）dsns的數據庫

最優的方式就是dsn指定從庫了。在從庫或從庫同網段主機里裝上 percona-toolkit。

在DSN_DBHOST 數據庫實例上創建DSNs表：

create database percona; CREATE TABLE `percona`.`dsns` ( `id` int(11) NOT NULL AUTO_INCREMENT, `parent_id` int(11) DEFAULT NULL, `dsn` varchar(255) NOT NULL, PRIMARY KEY (`id`)
); GRANT ALL PRIVILEGEES on percona.* to percona_tk@'PTCHECK_HOST' IDENTIFIED BY 'percona_pass';

如果有多個實例要檢查，可以創建多個類似的dsns表。上面的percona_tk用戶只是用來訪問dsn庫。插入從庫信息：

use percona; insert into dsns(dsn) values('h=REPLICA_HOST,P=3306,u=repl_user,p=repl_pass');

DSNs記錄 dsn 列格式如 h=REPLICA_HOST,u=repl_user,p=repl_pass

在 PTCHECK_HOST 上執行檢查命令：

# pt-table-checksum --replicate=percona.checksums --nocheck-replication-filters --no-check-binlog-format \ h=MASTER_HOST,u=repl_user,p='repl_pass',P=13306 --databases-regex=d_ts.* \ --recursion-method dsn=h=DSN_DBHOST,u=percona_tk,p='percona_pass',P=3306,D=percona,t=dsn

選項的意思就不多說了。

檢測完如果一致，其實是求個心安，特別是在做數據遷移的時候。如果不一致，那就需要借助 pt-table-sync 工具了，不作介紹。

常見錯誤

1. Diffs cannot be detected because no slaves were found
   不能自動找到從庫，確認processlist或host或dsns方式用對了。

2. Cannot connect to h=slave1.*.com,p=...,u=percona_user
   可以在pt-table-checksum命令前加PTDEBUG=1來看詳細的執行過程，如端口、用戶名、權限錯誤。

3. Waiting for the --replicate table to replicate to XXX
   問題出在 percona.checksums 表在從庫不存在，根本原因是沒有從主庫同步過來，所以看一下從庫是否延遲嚴重。

4. Pausing because Threads_running=25
   反復打印出類似上面停止檢查的信息。這是因為當前數據庫正在運行的線程數大于默認25，pt-table-checksum 為了減少對庫的壓力暫停檢查了。等數據庫壓力過了就好了，或者也可以直接 Ctrl+C 終端，下一次加上--resume繼續執行，或者加大--max-load=值。

5. 字符集問題

Error checksumming table Error executing checksum query: DBD::mysql::st execute failed: Illegal mix of collations
12-17T14:48:04 Error checksumming table d_ec_cs.t_online_cs: Error executing checksum query: 
DBD::mysql::st execute failed: Illegal mix of collations for operation 'concat_ws' [for Statement 
"REPLACE INTO `percona`.`ali_checksum` (db, tbl, chunk, chunk_index, lower_boundary, upper_boundary, this_cnt, this_crc) SELECT ?, ?, ?, ?, ?, ?, COUNT(*) AS cnt, COALESCE(LOWER(CONV(BIT_XOR(CAST(CRC32(CONCAT_WS('#', `f_cs_id`, `f_corp_id`, `f_valid`, `f_show_name`, `f_online_msg`, `f_offline_msg`, `f_show_mobile`, `f_group_id`, `f_qq`, `f_show_qq`, `f_msn`, `f_show_msn`, `f_sms_online`, `f_scheme`, `f_tel`, `f_telno`, `f_show_tel`, `f_contact`, `f_mobile`, `f_position`, `f_other1`, `f_other2`, `f_other_text1`, `f_other_text2`, `f_email`, `f_qq_first`, `f_qq_first_type`, `f_aids_open`, `f_aids_qq`, `f_aids_crmqq`, `f_aids_yahoo`, `f_aids_skype`, `f_aids_aliww`, `f_aids_msn`, `f_aids_alibaba`, `f_aids_alitrade`, CONCAT(ISNULL(`f_show_name`), ISNULL(`f_group_id`), ISNULL(`f_qq`), ISNULL(`f_show_qq`), ISNULL(`f_sms_online`), ISNULL(`f_other_text1`), ISNULL(`f_other_text2`), ISNULL(`f_email`)) )) AS UNSIGNED)), 10, 16)), 0) AS crc FROM `d_ec_cs`.`t_online_cs` 
/*checksum table*/" with ParamValues: 0='d_ts_profile', 1='t_user_account', 2=1, 3=undef, 4=undef, 5=undef] at /usr/bin/pt-table-checksum line 10520.

是個bug，暫時無法解決，Illegal mix of collations for operation 'concat_ws'。

轉自：https://segmentfault.com/a/1190000004309169