在Java中，使用File類來代表文件或目錄，可以通過setExecutable(), setReadable()和setWritable()方法來設置文件的權限。這些方法實際上是調用了底層操作系統提供的chmod命令來設置文件的權限。
chmod命令用于改變文件或目錄的權限，包括讀、寫、執行權限等。在Linux和Unix系統中，權限被分為三個部分：文件所有者、文件所有者所在的用戶組和其他用戶。文件的權限被分為讀、寫和執行權限，用數字表示，分別對應4、2和1。例如，讀寫權限為6、只讀權限為4。
在Java中，通過File類的setExecutable(), setReadable()和setWritable()方法可以設置文件的權限，但是只能設置當前Java程序運行的用戶對文件的權限。如果要設置其他用戶或用戶組的權限，需要使用Files類的setPosixFilePermissions()方法，并傳入對應的權限集合。
總之，Java中的chmod方法與文件的所有者之間的關系是，通過Java程序可以設置當前用戶對文件的權限，但對于其他用戶或用戶組的權限控制需要通過其他方式實現。
