系統優化與安全配置不足
Ubuntu默認安裝包含許多普通用戶不需要的組件，且未針對性能和安全進行充分優化，導致部分用戶認為其不夠高效和安全。例如，早期圖形界面響應速度慢于Mac OS X，影響了部分對性能要求較高的用戶體驗。
支持周期結束與升級壓力
Ubuntu 20.04 LTS等舊版本已于2025年2月結束免費支持周期，不再提供安全更新、漏洞修復或軟件包維護。用戶需升級至更新的LTS版本（如24.04 LTS）或購買Ubuntu Pro訂閱以保障系統安全，這對仍在使用舊版本的用戶造成了升級壓力。
市場競爭加劇
Ubuntu面臨來自Fedora、Debian、Rocky Linux等其他Linux發行版的激烈競爭。Fedora在系統更新頻率和用戶體驗上表現突出，Debian以穩定性著稱，吸引了部分追求新技術或特定功能的用戶，導致Ubuntu用戶基礎流失。
用戶體驗與性能問題
部分用戶反映Ubuntu升級過程常遇問題（如界面死機、系統崩潰），尤其是從LTS版本升級時。此外，Snap包管理系統的強制使用雖提高了安全性，但自動更新特性帶來了兼容性問題，影響了應用程序的功能和性能，引發用戶不滿。
技術路線與社區支持的爭議
Ubuntu的一些技術選擇（如Unity桌面環境、自研的Upstart、Mir）與其他主流Linux發行版不同，導致其在開源社區中的孤立。同時，社區對其參與度和影響力的評價有所減弱，部分用戶認為其對自由軟件社區的貢獻不足。
硬件兼容性與軟件支持局限
盡管Ubuntu支持多數現代硬件，但特定舊款設備（如某些打印機、掃描儀）仍需用戶自行尋找驅動程序。此外，專業軟件（如Adobe Photoshop、AutoCAD）對Linux系統的支持有限，導致需要遷移專業軟件的用戶遇到困難。
