PuppyLinux 支持的軟件包括但不限于：
- 瀏覽器：Firefox、Chromium、Seamonkey
- 辦公套件：LibreOffice、AbiWord、Gnumeric
- 圖像處理軟件：GIMP、Inkscape
- 音頻/視頻播放器：VLC、Audacious、MPlayer
- 輕量級文本編輯器：Geany、Leafpad
- 系統工具：GParted、Htop、Grsync
- 圖形界面配置工具：Puppy Package Manager、Quickpet
- 輕量級終端：Urxvt、LXTerminal
- PDF閱讀器：Xpdf、Evince
此外，PuppyLinux 還支持通過其自帶的 SFS（Squash File System）模塊來擴展軟件支持范圍，用戶可以安裝各種額外的軟件包來滿足自己的需求。
