Linux文件系統的安全防護是一個多層次的過程，涉及權限管理、加密技術、安全策略等多個方面。以下是一些關鍵的安全防護措施：
chmod命令設置文件和目錄的權限，確保敏感文件的權限設置為只允許必要的用戶訪問。useradd、usermod、groupadd和groupmod等命令來管理用戶和組信息，控制訪問權限。cryptsetup命令對文件和目錄進行加密，如LUKS（Linux Unified Key Setup）。rsync、tar等工具進行備份，并將備份存儲在安全的位置。auditd等工具監控文件系統的變化。iptables或firewalld等工具定義防火墻規則。通過綜合運用上述措施，可以顯著提高Linux文件系統的安全性，減少潛在的安全風險。
