CentOS下Compton與Wayland通常是兼容的。Compton原生支持Wayland協議，可在GNOME 3等Wayland桌面環境下正常運行。
不過，可能存在一些兼容性問題，如在Wayland環境下使用OBS Studio等錄屏軟件時可能出現問題。此外，如果使用的是較舊的CentOS版本或特定硬件配置，也可能遇到兼容性方面的挑戰。
