目前沒有公開資料表明FetchLinux支持哪些特定的文件系統。FetchLinux是基于SSH協議的文件傳輸工具，其文件系統支持情況可能取決于所使用的SSH服務器和客戶端的配置，以及Linux系統本身支持的文件系統。
一般來說，Linux系統原生支持ext2、ext3、ext4等文件系統，也支持NFS、SMB等網絡文件系統，以及ISO9660等光盤文件系統。
