DAVID數據庫是一個功能強大的生物信息學工具，它提供了全面的基因和蛋白質功能注釋、富集分析以及可視化功能。以下是一些具體的應用案例：
功能富集分析
- GO富集分析：通過分析基因在生物過程、細胞組分和分子功能上的富集情況，揭示基因集在基因本體論（GO）上的富集情況。
- KEGG富集分析：分析基因或蛋白在KEGG通路中的富集情況，幫助理解它們在代謝、遺傳信息處理、環境信息處理、細胞過程、有機系統、人類疾病和藥物開發等七個方面的作用。
基因功能注釋
- 功能注釋：為大規模的基因或蛋白質列表提供系統綜合的生物功能注釋信息，幫助用戶理解基因的功能和特性。
- 功能分類：通過聚類冗余的注釋術語，幫助用戶找到功能相關的基因群體。
數據可視化
- 氣泡圖：通過氣泡圖展示富集分析結果，幫助用戶直觀理解基因在特定通路中的富集情況。
基因ID轉換
- 轉換工具：實現不同數據庫的基因標識間的轉換，包括NCBI、PIR和Uniprot/SwissProt等重要數據庫的基因標識信息。
通路可視化
- 通路圖：可視化基因在BioCarta & KEGG通路圖上的位置，幫助理解基因如何在整個生物系統中相互作用。
應用領域
- 轉錄組分析：在轉錄組分析中，DAVID常用于差異基因或蛋白的功能和通路富集分析。
通過這些應用案例，可以看出DAVID數據庫在生物信息學領域中的廣泛應用和重要性。無論是功能富集分析、基因功能注釋、數據可視化，還是基因ID轉換和通路可視化，DAVID都提供了一個全面而強大的平臺，幫助研究人員深入理解基因和蛋白質的功能和相互作用。
